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== Classification botanique ==
Les agrumes appartiennent à la famille des '''Rutaceae''', tribu des '''Citreae''', sous-tribu des '''Citrinae'''. Le genre ''Citrus'' sensu lato englobe aujourd'hui, selon la classification APG IV et les travaux phylogénomiques récents (Wu et al., 2018), l'ensemble des genres traditionnellement séparés : ''Citrus'', ''Fortunella'', ''Poncirus'', ''Microcitrus'', ''Eremocitrus'' et ''Clymenia''.

== Les trois espèces ancestrales ==
Les analyses génomiques ont révélé que la quasi-totalité des agrumes cultivés sont des hybrides issus de trois espèces sauvages fondatrices :
* '''''Citrus medica''''' L. — le cédrat (origine : nord-est de l'Inde, Assam)
* '''''Citrus reticulata''''' Blanco — le mandarinier (origine : Chine du Sud, Indochine)
* '''''Citrus maxima''''' (Burm.) Merr. — le pamplemoussier (origine : archipel malais)

Ces trois espèces se sont hybridées naturellement ou sous influence humaine depuis des millénaires pour donner naissance à tous les agrumes cultivés.

== Origine des espèces cultivées ==
{| class="wikitable"
! Espèce cultivée || Parenté génétique (approximative)
|-
| Oranger doux (''C. sinensis'') || Pamplemoussier × mandarinier
|-
| Citronnier (''C. limon'') || Cédrat × citron aigre
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| Citron aigre/bigaradier (''C. aurantium'') || Pamplemoussier × mandarinier
|-
| Pomelo (''C. paradisi'') || Pamplemoussier × oranger doux
|-
| Clémentine (''C. clementina'') || Mandarinier × oranger doux
|-
| Bergamote (''C. bergamia'') || Citronnier × lime douce (probable)
|-
| Lime mexicaine (''C. aurantiifolia'') || Cédrat × microcitrus (probable)
|-
| Lime de Tahiti (''C. latifolia'') || Lime mexicaine × cédrat (triploïde)
|-
| Yuzu (''C. junos'') || Mandarinier × Ichang papeda
|}

== Morphologie générale ==
Les agrumes sont des arbustes à arbres à feuillage '''persistant''' (à l'exception de ''Poncirus trifoliata'', caduc). Leurs caractères distinctifs incluent :
* '''Feuilles''' : simples ou unifoliolées (avec pétiole ailé chez les vrais Citrus), glandes à huiles essentielles visibles par transparence
* '''Fleurs''' : blanches à crème, 4–5 pétales, nombreuses étamines (20–60), très parfumées
* '''Fruit (hespéride)''' : baie à péricarpe composé de l'épicarpe (flavedo, zeste coloré), mésocarpe (albédo, partie blanche) et endocarpe (quartiers de pulpe)
* '''Épines''' : présentes chez de nombreuses espèces, absentes chez certains cultivars sélectionnés

== Floraison et pollinisation ==
La floraison des agrumes est déclenchée par :
* Le stress hydrique (sécheresse hivernale)
* Les basses températures (induction florale en dessous de 15°C)
* La photopériode (influence secondaire)

La pollinisation est généralement entomophile (abeilles, bourdons). De nombreux cultivars sont auto-compatibles (auto-allogames) ; d'autres produisent des fruits sans pépins en l'absence de pollinisateurs (parthénocarpie).

== Notes et références ==
* Wu, G.A. et al. (2018). Genomics of the origin and evolution of Citrus. ''Nature'', 554(7692), 311–316. DOI:10.1038/nature25447.
* Swingle, W.T. & Reece, P.C. (1967). The botany of Citrus and its wild relatives. ''The Citrus Industry'', Vol. 1. UCR.
* Mabberley, D.J. (1997). A classification for edible Citrus. ''Telopea'', 7(2), 167–172.
* Nicolosi, E. et al. (2000). Citrus phylogeny and genetic origin of important species. ''Molecular Phylogenetics and Evolution'', 15(1), 209–219.

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